Biologe (m/w/d) (Biologe/Biologin)

Das Friedrich-Loeffler-Institut gehört zu den weltweit führenden Forschungsinstituten auf dem Gebiet der Tierseuchen, des Tierschutzes, der Tierhaltung, der Tierernährung und der Nutztiergenetik. Es gehört zum Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Landwirtschaft, Ernährung und Heimat und unterrichtet und berät die Bundesregierung auf diesen Gebieten.Am Standort Jena, im Institut für bakterielle Infektionen und Zoonosen (IBIZ) suchen wir zum 01.01.2027eine wissenschaftliche Mitarbeiterin / einen wissenschaftlichen Mitarbeiter (Doktorandin / Doktorand) (w/m/d)befristet bis 30.09.2029, mit 65 % der regelmäßigen wöchentlichen Arbeitszeit.Das vom Bundesministerium für Landwirtschaft, Ernährung und Heimat geförderte Projekt „Fütterung von Schweinen in der Absetz- und Mastperiode entsprechend ihres Aminosäurenbedarfs mit regional erzeugter Kleegrassilage“ zielt darauf ab, den Effekt steigender Mengen an Kleegrassilage (KGS) auf die mit dem Darmmikrobiom assoziierte Tiergesundheit (Erkrankungsraten/Therapiehäufigkeit, Antibiotikaresistenzen im ökologischen Landbau), die tierischen Leistungen und Produkte (Mastleistung und Schlachtkörperqualität) sowie die Stickstoff- und Aminosäurenverwertung der Tiere zu prüfen.Etablierung der Sequenzierung metagenomischer Proben sowie der anschließenden bioinformatischen AuswertungUntersuchungen zum Darmmikrobiom während des Schweine-Mastzyklusmikrobiologische Arbeiten mit verschiedenen kommensalen und pathogenen Bakterien der biologischen Schutzstufen 1-3 zur ProbenvorbereitungAntibiotikaresistenztestungmolekularbiologische Arbeiten (DNA-Extraktion, Nukleinsäure-Amplifikationstechniken, NGS)ein abgeschlossenes Hochschulstudium der Veterinärmedizin, Biologie, Biochemie oder einer vergleichbaren naturwissenschaftlichen DisziplinKenntnisse und Erfahrung mit grundlegenden bakteriologischen Arbeitstechniken und AnalysemethodenErfahrung in der Implementierung neuer Methodensehr gute Kommunikationsfähigkeiten in Deutsch und Englisch in Wort und Schriftvon Vorteil sind:Erfahrung mit Arbeiten in akkreditierten Laboren der Schutz-/Sicherheitsstufen S2 sowie im Umgang mit KrankheitserregernErfahrung mit Methoden zur AntibiotikaresistenztestungErfahrung mit molekularbiologischen UntersuchungsmethodenErfahrungen in Ganzgenomsequenzierung mittels Illumina- und Nanopore-Technologie sowie in der bioinformatischen Auswertung der generierten DatenEine selbstständige und zuverlässige Arbeitsweise, eine gute Arbeitsorganisation, Motivation...

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